Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Paxbp1P58501 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Paxbp1P58501 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms