Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Dpf3P58269 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Dpf3P58269 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms