Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samsn1P57725 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samsn1P57725 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms