Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gp1bbP56400 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms