Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CartptP56388 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CartptP56388 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CartptP56388 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CartptP56388 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CartptP56388 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CartptP56388 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CartptP56388 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CartptP56388 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CartptP56388 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CartptP56388 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CartptP56388 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CartptP56388 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CartptP56388 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CartptP56388 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CartptP56388 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CartptP56388 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CartptP56388 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CartptP56388 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CartptP56388 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CartptP56388 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CartptP56388 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CartptP56388 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CartptP56388 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CartptP56388 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CartptP56388 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CartptP56388 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CartptP56388 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CartptP56388 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CartptP56388 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CartptP56388 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CartptP56388 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CartptP56388 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CartptP56388 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CartptP56388 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CartptP56388 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CartptP56388 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CartptP56388 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CartptP56388 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CartptP56388 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CartptP56388 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CartptP56388 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CartptP56388 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CartptP56388 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CartptP56388 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CartptP56388 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CartptP56388 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CartptP56388 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CartptP56388 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CartptP56388 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CartptP56388 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CartptP56388 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CartptP56388 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CartptP56388 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CartptP56388 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CartptP56388 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CartptP56388 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CartptP56388 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CartptP56388 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CartptP56388 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CartptP56388 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CartptP56388 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CartptP56388 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CartptP56388 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CartptP56388 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CartptP56388 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CartptP56388 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CartptP56388 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CartptP56388 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CartptP56388 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms