Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atp5eP56382 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms