Protein–RNA interactions for Protein: P55849

Dsc1, Desmocollin-1, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc1P55849 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsc1P55849 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsc1P55849 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms