Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SftpbP50405 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SftpbP50405 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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SftpbP50405 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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SftpbP50405 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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SftpbP50405 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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SftpbP50405 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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SftpbP50405 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SftpbP50405 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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