Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tmod1P49813 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tmod1P49813 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms