Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psen1P49769 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psen1P49769 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psen1P49769 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psen1P49769 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psen1P49769 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms