Protein–RNA interactions for Protein: P48540

Gdnf, Glial cell line-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GdnfP48540 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GdnfP48540 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GdnfP48540 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GdnfP48540 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GdnfP48540 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GdnfP48540 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GdnfP48540 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GdnfP48540 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GdnfP48540 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
GdnfP48540 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms