Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rfx2P48379 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms