Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rfx1P48377 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rfx1P48377 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms