Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrprbP47758 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrprbP47758 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SrprbP47758 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrprbP47758 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SrprbP47758 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SrprbP47758 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms