Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pax7P47239 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax7P47239 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pax7P47239 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms