Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cdkn1bP46414 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms