Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NodalP43021 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NodalP43021 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NodalP43021 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NodalP43021 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NodalP43021 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NodalP43021 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NodalP43021 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
NodalP43021 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
NodalP43021 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NodalP43021 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NodalP43021 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NodalP43021 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NodalP43021 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NodalP43021 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NodalP43021 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NodalP43021 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NodalP43021 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NodalP43021 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NodalP43021 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
NodalP43021 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NodalP43021 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NodalP43021 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NodalP43021 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NodalP43021 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NodalP43021 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NodalP43021 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
NodalP43021 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
NodalP43021 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
NodalP43021 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NodalP43021 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NodalP43021 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NodalP43021 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NodalP43021 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NodalP43021 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NodalP43021 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NodalP43021 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms