Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd9P40240 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd9P40240 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cd9P40240 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd9P40240 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd9P40240 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd9P40240 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd9P40240 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd9P40240 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd9P40240 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd9P40240 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd9P40240 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd9P40240 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd9P40240 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd9P40240 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd9P40240 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd9P40240 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd9P40240 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd9P40240 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd9P40240 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cd9P40240 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd9P40240 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms