Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd1P40201 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd1P40201 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd1P40201 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd1P40201 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd1P40201 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd1P40201 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chd1P40201 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd1P40201 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chd1P40201 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms