Protein–RNA interactions for Protein: P40124

Cap1, Adenylyl cyclase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cap1P40124 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cap1P40124 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cap1P40124 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cap1P40124 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cap1P40124 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cap1P40124 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cap1P40124 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cap1P40124 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cap1P40124 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cap1P40124 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cap1P40124 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cap1P40124 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cap1P40124 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cap1P40124 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cap1P40124 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cap1P40124 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cap1P40124 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cap1P40124 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cap1P40124 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cap1P40124 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cap1P40124 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cap1P40124 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms