Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Grik2P39087 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms