Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TtlP38585 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TtlP38585 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TtlP38585 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TtlP38585 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
TtlP38585 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TtlP38585 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TtlP38585 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TtlP38585 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TtlP38585 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TtlP38585 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TtlP38585 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TtlP38585 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TtlP38585 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TtlP38585 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TtlP38585 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TtlP38585 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TtlP38585 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TtlP38585 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TtlP38585 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TtlP38585 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TtlP38585 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TtlP38585 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TtlP38585 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms