Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sar1aP36536 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sar1aP36536 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms