Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Apoc1P34928 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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