Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp2P29594 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp2P29594 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp2P29594 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp2P29594 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp2P29594 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casp2P29594 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms