Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkcdP28867 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PrkcdP28867 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms