Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RxraP28700 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RxraP28700 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RxraP28700 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RxraP28700 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RxraP28700 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RxraP28700 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RxraP28700 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RxraP28700 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RxraP28700 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RxraP28700 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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