Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Hoxd10P28359 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms