Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Defa5P28312 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Defa5P28312 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Defa5P28312 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms