Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gjb1P28230 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms