Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Psmb9P28076 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Psmb9P28076 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms