Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lmo2P25801 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmo2P25801 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms