Protein–RNA interactions for Protein: P23738

Hdc, Histidine decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HdcP23738 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HdcP23738 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HdcP23738 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HdcP23738 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HdcP23738 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HdcP23738 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HdcP23738 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HdcP23738 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HdcP23738 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HdcP23738 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HdcP23738 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HdcP23738 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HdcP23738 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HdcP23738 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HdcP23738 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HdcP23738 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HdcP23738 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HdcP23738 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HdcP23738 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HdcP23738 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HdcP23738 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HdcP23738 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HdcP23738 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HdcP23738 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HdcP23738 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HdcP23738 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HdcP23738 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HdcP23738 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HdcP23738 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HdcP23738 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HdcP23738 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HdcP23738 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HdcP23738 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HdcP23738 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HdcP23738 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HdcP23738 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HdcP23738 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HdcP23738 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HdcP23738 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms