Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tsta3P23591 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms