Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pde6bP23440 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pde6bP23440 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pde6bP23440 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pde6bP23440 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pde6bP23440 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pde6bP23440 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pde6bP23440 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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Pde6bP23440 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pde6bP23440 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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