Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja1P23242 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gja1P23242 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Gja1P23242 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja1P23242 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja1P23242 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja1P23242 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja1P23242 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms