Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PparaP23204 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PparaP23204 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PparaP23204 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PparaP23204 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PparaP23204 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PparaP23204 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PparaP23204 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PparaP23204 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PparaP23204 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PparaP23204 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PparaP23204 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PparaP23204 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PparaP23204 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PparaP23204 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PparaP23204 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PparaP23204 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PparaP23204 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PparaP23204 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PparaP23204 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PparaP23204 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PparaP23204 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PparaP23204 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PparaP23204 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PparaP23204 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PparaP23204 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PparaP23204 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PparaP23204 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PparaP23204 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PparaP23204 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PparaP23204 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PparaP23204 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PparaP23204 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PparaP23204 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PparaP23204 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms