Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ms4a2P20490 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ms4a2P20490 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms