Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Fcer1aP20489 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Fcer1aP20489 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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