Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
PrkcaP20444 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PrkcaP20444 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms