Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TP20293 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TP20293 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TP20293 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
TP20293 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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