Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NefhP19246 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NefhP19246 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NefhP19246 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NefhP19246 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NefhP19246 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NefhP19246 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NefhP19246 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NefhP19246 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NefhP19246 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NefhP19246 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NefhP19246 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NefhP19246 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NefhP19246 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NefhP19246 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NefhP19246 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NefhP19246 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NefhP19246 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NefhP19246 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NefhP19246 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NefhP19246 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NefhP19246 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NefhP19246 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NefhP19246 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NefhP19246 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NefhP19246 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NefhP19246 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NefhP19246 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NefhP19246 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NefhP19246 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NefhP19246 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NefhP19246 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NefhP19246 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NefhP19246 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NefhP19246 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NefhP19246 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NefhP19246 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NefhP19246 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NefhP19246 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NefhP19246 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NefhP19246 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NefhP19246 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NefhP19246 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NefhP19246 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NefhP19246 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NefhP19246 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NefhP19246 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NefhP19246 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NefhP19246 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NefhP19246 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NefhP19246 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NefhP19246 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NefhP19246 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NefhP19246 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NefhP19246 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NefhP19246 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NefhP19246 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NefhP19246 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NefhP19246 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NefhP19246 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NefhP19246 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NefhP19246 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NefhP19246 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NefhP19246 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NefhP19246 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NefhP19246 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NefhP19246 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NefhP19246 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NefhP19246 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NefhP19246 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NefhP19246 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NefhP19246 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NefhP19246 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NefhP19246 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms