Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsdP18242 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsdP18242 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsdP18242 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsdP18242 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsdP18242 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsdP18242 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsdP18242 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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