Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
PtpraP18052 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpraP18052 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtpraP18052 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms