Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Defa-rs1P17533 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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Defa-rs1P17533 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Defa-rs1P17533 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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