Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp53P15975 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp53P15975 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp53P15975 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp53P15975 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp53P15975 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms