Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnmt1P13864 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnmt1P13864 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms