Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm20239-201ENSMUST00000196610 982 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chrm1P12657 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chrm1P12657 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms