Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Schip1P0DPB4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Schip1P0DPB4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms