Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Dnmt3cP0DOY1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms